Biopolymers and cell. 2010; 26 (4): 279 - 285
Мобильный генетический элемент Serratia marcescens, возбудителя заболевания лука
Л. П. Овчаренко, Т. H. Вознюк, И. E. Заец, А. И. Потопальский, О. Рева, Н. Kозыровская
Цель. Проверить наявность мобильных генетических элементов (МГЭ) у бактерии, вызывающей гниль выращенного в полевых условиях лука, и изучеить интегрон вместе с ассоциированными с ним кассетами генов. Методы. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) и секвенирование продуктов ПЦР использовали для идентификации бактерии и МГЭ. Метод анализа полиморфизма длины терминально-меченних рестрикционных фрагментов ПЦР-продуктов применен для определения изолированой бактерии в тканях луковиц. Результаты. Анализируя последовности нуклеотидов гена 16S рРНК изолята с гнилого лука, сделано вывод о том, что бактерия принадлежит к виду S. marcescens, известного фитопатогена. Однако этот изолят не реагировал на специфеские праймеры, характерные для фитопатогенных сератий. Инокулирование лука (Allium cepa L.), Arabidopsis thaliana (L.) Heyhn и салата (Lactuca sativa) приводило к возрастанию биомассы растений без проявления симптомов болезни. Интегрон первого класса выявлен с помощью ПЦР в геноме фитопатогенной S. marcescens впервые. Кассеты генов интегрона представлены беспромоторными генами, кодирующими формиминоглутамат деиминазу и фер- мент IIC аскорбатфосфотрансферазной системы, а также тремя некодирующими последовностями, фланкированными 59-п. н.-элементом. Выводы. S. marcescens IMBG291 проявляет патогенные свойства или стимулирует развитие растения в зависимости от экологической ситуации, благодаря горизонтально приобретенным генным кассетам, расположенным на интегроне.
Ключевые слова: Serratia marcescens, болезнь лука, интегрон, генные кассеты