Biopolymers and Cell 27(6) P 472-479

ЧАСТИЧНОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ И ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ВИРУСА МОЗАИКИ СОИ, ИЗОЛИРОВАННОГО В УКРАИНЕ

Шерепитко Д. В., Будзановская И. Г., Полищук В. П., Бойко А. Л.

Киевский национальный университет имени Тараса Шевченко
ул. Владимирская, 64, Киев, Украина, 01601

Цель. Сравнить молекулярно-биологические свойства украинских изолятов вируса мозаики сои (ВМС) со свойствами известных иностранных изолятов этого вируса, а также проследить их возможное происхождение. Методы. Механическая инокуляция, полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией, секвенирование ДНК и филогенетический анализ. Результаты. На селекционных участках в Винницкой области отобраны и в последующем очищены пять изолятов ВМС. Показано, что все изучаемые изоляты демонстрируют одинаковый спектр реакций на 11 дифференцирующих сортах сои. Филогенетический анализ нуклеотидных и соответствующих аминокислотных последовательностей генов СР и Р1 выявил высокий уровень филогенетического родства между репрезентативным украинским (UA1Gr) и американским (VA2) изолятами ВМС, вошедшими в один кластер со штаммом G2. Результаты сравнения нуклеотидных последовательностей подтвердили предположенипе о том, что разные участки генома ВМС находятся под различным эволюционным давлением. Выводы. Выделенные в Украине изоляты ВМС принадлежат к штаммовой группе G2 и, вероятно, являются привнесенными с территории Северной Америки. На наш взгляд, полученные в данной работе изоляты ВМС актуально использовать в отечественных селекционных программах для создания вирусоустойчивых сортов сои.

Ключевые слова: вирус мозаики сои, потивирус, Glycine max, последовательности нуклеотидов, филогенетический анализ.

 

Summary in English