Biopolym. Cell. 2009; 25(1):50-55.
Вирусы и клетка
Анализ молекулярных особенностей украинских изолятов ВИЧ-1
1Пукиш Н. С., 2Щербинская А. М., 2Бабий Н. О., 1Полищук В. П.
  1. Киевский национальный университет имени Тараса Шевченко
    ул. Владимирская 64, Киев, Украина, 01601
  2. Украинский центр профилактики и борьбы со СПИДом МОЗ Украины
    ул. Николая Амосова, 5, Киев, Украина, 03038

Abstract

Проведен анализ генома ВИЧ-1 в области гена pol 64 образцов крови ВИЧ-инфицированных лиц с использованием метода определения нуклеотидной последовательности нуклеиновой кислоты. Установлено, что доминирующим среди исследованных образцов оказался субтип А, а значительное количество изолятов относится к циркулирующим рекомбинантным формам ВИЧ-1. В результате анализа обнаружена одна мутация, связанная с развитием резистентности ВИЧ-1 к антиретровирусным препаратам. В большинстве образцов выявлены полиморфические изменения нуклеотидов в исследованном участке генома ВИЧ-1.
Keywords: вирус иммунодефицита человека-1, полиморфические изменения, мутации резистентности, рекомбинантные формы ВИЧ-1, субтип ВИЧ-1

References

[1] Gallo R. C., MontagnierL. The discovery of HIV as the cause of AIDS New Engl. J. Med 2003 349, N 24:2283– 2285.
[2] UNAIDS. AIDS Epidemic Update: December 2007.
[3] Requejo H. Worldwide molecular epidemiology of HIV Rev. Saude Publica 2006 40, N 2:331–345.
[4] Peters M., Sharp R. M. Genetic diversity of HIV-1: the moving target. AIDS. 2000; 14(3):129–140.
[5] McCutchan F. E. Understanding the genetic diversity of HIV1. AIDS. 2000; 14(3):31–44.
[6] Barlet J., Galant J. Clinical aspects of HIV-infection M.: EnRus, 2007 557 p.
[7] de Ronde A., van Dooren M., van der Hoek L., Bouwhuis D., de Rooij E., van Gemen B., de Boer R., Goudsmit J. Esteblishment of new transmissible and drug sensitive human immunodeficiency virus type 1 wild types due to transmission of nucleoside analogue-resistant virus J. Virol 2001 75:595–602.
[8] Clavel F., Hance A. HIV drug resistance New Engl. J. Med 2004 350, N 10:1023–1035.
[9] Vijver D., Wensing A., Boucher C. The epidemiology of transmission of drug resistant HIV-1. Sequence compendium 2006/2007 Los Alamos, 2007:17–36.
[10] Tatt I., Barlow K., Nicoll A., Clewley J. The public health significance of HIV-1 subtypes. AIDS. 2001; 15, N 24 P. 59–71.
[11] Saad M., Shcherbinskaya A., Nadai Y., Kruglov Y., Antonenko S., Lyullchuk M., Kravchenko O., Earhart K., Sanchez J., Birx D., Carr J. Molecular epidemiology of HIV type 1 in Ukraine: birthplace of an epidemic AIDS Res. and Hum. Retroviruses 2006 22, N 8:709–714.
[12] Nabatov A., Kravchenko O., Lyulchuk M., Shcherbinskaya A., Lukashov V. Simultaneous introduction of HIV type 1 subtype A and B viruses into injecting drug users in southern Ukraine at the beginning of the epidemic in the former Soviet Union AIDS Res. and Hum. Retroviruses 2002 18, N 12:891–895.
[13] Johnson V., Vezinet F., Clotet B., Gunthart H., Kuritzkes D., Pillay D., Shapiro J., Richman D. Update of drug resistance mutations in HIV-1: 2007 Top. HIV Med. 2007; 15(4):119–125.
[14] Johnson V., Brun-Vezinet F., Cloet B., Gunthart H., Kuritzkes D., Pillay D., Shapiro J., Richman D. Update of Drug Resistance Mutations in HIV-1: 2006. Top. HIV Med. 2006; 14(3):125–130.
[15] Shafer R., Rhee S., Pillay D., Miller V., Sandstrom P., Shapiro J., Kuritzkes D., Bennet D. HIV-1 protease and reverse transcriptase mutations for drug resistance surveillance AIDS 2007 21:215–223.
[16] HIV drug resistance mutations by drug class (January 28, 2008) – http://hivdb.standford.edu
[17] Sukasem C., Churdboonchart V., Sukeepaisarncharoen W., Piroj W., Inwisai T., Tiensuwan M., Chantratita W. Genotypic resistance profiles in antiretroviral-naVve HIV-1 infections before and after initiation of first-line HAART: impact of polymorphism on resistance to therapy Int. J. Antimicrob. Agents 2008 31, N 3:277–281.
[18] Hu D., Subbarao S., Vanichseni S., Mock P., Ramos A., Nguyen L., Chaowanachan T., Griensven F., Choopanya K., Mastro T., Tappero J. Frequency of HIV-1 dual subtype infections, including intersubtype infections, among injection drug users in Bangkok, Thailand. AIDS. 2005;19(3):303-8.