Biopolym. Cell. 1998; 14(2):156-162.
Методи
Застосування методу LOGIS для передбачення вторинної структури білка
1Братусь О. В., 1Чащин М. О.
  1. Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
    Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03680

Abstract

У роботі для прогнозування вторинної структури білків запропоновано новий метод розпізнавання образів, відомий як метод LOGIS. Навчання та передбачення грунтуються на даних про вторинну структуру 108 білків (біля 20000 амінокислотних залишків) з рентгеноструктурним розділенням менше 0,2 нм. Середня точність передбачення складає 71 %.

References

[1] Sternberg MJ, Islam SA. Local protein sequence similarity does not imply a structural relationship. Protein Eng. 1990;4(2):125-31.
[2] Sergienko IV, Gupal AM, Bratus AV. LOG1S-system realizing statistical abductive conclusion on empirical data. Kibernetika. 1995;3: 160-73.
[3] Kendall M, Stuart A. Multivariate statistical analysis and time series. M.: Nauka, 1976: 65-68.
[4] Bratus AU, Maltchenko SZ, Chaschin NA. The proteins secondary structure prediction by the modified GUHA-method. Biopolym Cell. 1993; 9(5):61-6.
[5] Rost B, Sander C. Combining evolutionary information and neural networks to predict protein secondary structure. Proteins. 1994;19(1):55-72.