Biopolym. Cell. 1999; 15(5):449-455.
http://dx.doi.org/10.7124/bc.00053E
Методи
Взаємодія ціанінових барвників з нуклеїновими кислотами. 11. Синтез та спектральні властивості нових 216-диметил-4-[(3-метил-1,3-бензтіазол-3-іум-2-їл) метилен] - 1,4-дигідро-1 -піридинієвих гомодимерних ціанінових барвників
1Кочешев І. О., 1Ковальська В. Б., 1Ярмолюк С. М.
  1. Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
    вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03680

Abstract

Запропоновано новий зручний метод синтезу гомодимерів ціанінових барвників за допомогою реакції первинних амінів з пірилісвими солями, що дозволяє отримувати гомодимери з різними за довжиною та хімічним складом лінкерамш Вивчено спектрально-люмінесцентні властивості синтезованих барвників та їхніх комплексів з нуклеїновими кислотами, а також залежність цих властивостей від довжини та хімічної природи лінкера. Синтезований барвник К6 у комплексі з ДНК продемонстрував підвищення інтенсивності флюоресценції приблизно у 1500 разів, так, на нашу думку, перспективним як флюорещентний зонд для детекції нуклеїнових кислот
Повний текст: (PDF, українською)

References

[1] Gaugain B, Barbet J, Oberlin R, Roques BP, Le Pecq JB. DNA bifunctional intercalators. I. Synthesis and conformational properties of an ethidium homodimer and of an acridine ethidium heterodimer. Biochemistry. 1978;17(24):5071-8.
[2] Rye HS, Yue S, Wemmer DE, Quesada MA, Haugland RP, Mathies RA, Glazer AN. Stable fluorescent complexes of double-stranded DNA with bis-intercalating asymmetric cyanine dyes: properties and applications. Nucleic Acids Res. 1992;20(11):2803-12.
[3] Rye HS, Quesada MA, Peck K, Mathies RA, Glazer AN. High-sensitivity two-color detection of double-stranded DNA with a confocal fluorescence gel scanner using ethidium homodimer and thiazole orange. Nucleic Acids Res. 1991;19(2):327-33.
[4] Rye HS, Drees BL, Nelson HC, Glazer AN. Stable fluorescent dye-DNA complexes in high sensitivity detection of protein-DNA interactions. Application to heat shock transcription factor. J Biol Chem. 1993;268(33):25229-38.
[5] Goodwin PM, Johnson ME, Martin JC, Ambrose WP, Marrone BL, Jett JH, Keller RA. Rapid sizing of individual fluorescently stained DNA fragments by flow cytometry. Nucleic Acids Res. 1993;21(4):803-6.
[6] Carlsson C, Larsson A, Jonsson M, Norden B. Dancing DNA in capillary solution electrophoresis () Journal of the American Chemical Society. 1995;117 (13):3871-3872.
[7] Kryvorotenko D. V., Kovalska V. B., Yarmoluk S. M. The interaction of cyanine dyes with nucleic acids. 16. New fluorescent benzothiazole-4-[2,6-dimethylpyridinium] monomethyne cyanine dyes Biopolym. Cell, 2000;16(4):320-326
[8] Grinshteyn J, Vinits M. Chemistry of amino acids and peptides. Moscow: Mir, 1965. 465 p.
[9] Brooker L.G.S. Color and constitution. V. The absorption of unsymmetrical cyanines. Resonance as a basis for a classification of dyes. Journal of the American Chemical Society 1942; 64 (2):199-210.
[10] Rye HS, Glazer AN. Interaction of dimeric intercalating dyes with single-stranded DNA. Nucleic Acids Res. 1995;23(7):1215-22.
[11] Spielmann HP, Wemmer DE, Jacobsen JP. Solution structure of a DNA complex with the fluorescent bis-intercalator TOTO determined by NMR spectroscopy. Biochemistry. 1995;34(27):8542-53.
[12] Staerk D, Hamed AA, Pedersen EB, Jacobsen JP. Bisintercalation of homodimeric thiazole orange dyes in DNA: effect of modifying the linker. Bioconjug Chem. 1997;8(6):869-77.