Biopolym. Cell. 1992; 8(3):23-29.
Структура та функції біополімерів
Виявлення pUC19-гомологічних повторюваних послідовностей у геномі деяких видів вищих рослин
1Пацковський Ю. В., 1Гайдук В. В., 1Веселовський О. В., 2Зубко О. І., 2Пастернак Т. П., 1Юркевич Л. М., 2Машталер С. Г., 1Потопальський А. І.
  1. Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
    Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03680
  2. Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України
    вул. Академіка Заболотного, 148, Київ, Україна, 03680

Abstract

За допомогою методу блот-гібридизації за Саузерном у складі ядерної ДНК кількох видів вищих рослин (Secale сегеаіе, Zea mays, Triticum aestivum, Solanum nigrum, S. tuberosum, Atropa belladonna, Licopersicon esculentum) виявлено послідовності, що повторюються, гомологічні ДНК плазміди pUC19. У Складі геномної ДНК жита і красавки вони розміщені у вигляді кластерів. Встановлено розбіжності у числі та організації puC-повторів в геномах різних видів і окремих ліній (поколінь – у жита) одного виду. Показано можливість використання pUC-повторів як маркерів при соматичній гібридизації беладонни та тютюну. Обговорюється можливий зв'язок виявлених фактів з нестабільністю генома рослин.

References

[1] Il'in IuV. Repeated genes in eukaryotes. Mol Biol (Mosk). 1982;16(2):229-57.
[2] Koukalová B, Reich J, Matyášek R, Kuhrová V, Bezděk M. A BamHI family of highly repeated DNA sequences of Nicotiana tabacum. Theor Appl Genet. 1989;78(1):77-80.
[3] Ganal MW, Lapitan NLV, Tanksley SD. A molecular and cytogenetic survey of major repeated DNA sequences in tomato (Lycopersicon esculentum). Mol Gen Genet. 1988;213(2-3):262–8.
[4] Zamir D, Tanksley SD. Tomato genome is comprised largely of fast-evolving, low copy-number sequences. Mol Gen Genet. 1988;213(2-3):254–61.
[5] Simoens CR, Gielen J, Van Montagu M, Inzé D. Characterization of highly repetitive sequences of Arabidopsis thaliana. Nucleic Acids Res. 1988;16(14B):6753-66.
[6] Jones JDG, Flavell RB. The mapping of highly-repeated DNA families and their relationship to C-bands in chromosomes of Secale cereale. Chromosoma. 1982;86(5):595–612.
[7] Appels R, Moran LB, Gustavson JP. The structure of DNA from the rye (Secale cereale) NORRI locus and its behavior in wheat backgrounds. Can J Genet Cytol. 1986; 28(2): 673-85.
[8] Ranade SA, Lagu MD, Patankar SM, Dabak MM, Dhar MS, Gupta VS, Ranjekar PK. Identification of a dispersed MboI repeat family in five higher plant genomes. Biosci Rep. 1988;8(5):435-41.
[9] Deumling B. Sequence arrangement of a highly methylated satellite DNA of a plant, Scilla: A tandemly repeated inverted repeat. Proc Natl Acad Sci U S A. 1981;78(1):338-42.
[10] Kato A, Yakura K, Tanifuji S. Sequence analysis of Vicia faba repeated DNA, the FokI repeat element. Nucleic Acids Res. 1984;12(16):6415-26.
[11] Zimmerman PA, Lang-Unnasch N, Cullis CA. Polymorphic regions in plant genomes detected by an M13 probe. Genome. 1989;32(5):824–8.
[12] Zubko MK, Zubko EI, Kapranov PhV. Induction of chlorophyll deficient tobacco mutants as markers for cell engineering. Biopolym Cell. 1991;7(4):72-9.
[13] Vlasák J. Effect of different disintegration techniques and media on yield and appearance of isolated nuclei. Biol Plan. 1981;23(6):406–13.
[14] Maniatis T, Fritsch EF, Sambrook J. Molecular cloning: a laboratory manual. New York: Cold Spring Harbor Lab, 1982; 545 p.
[15] Westneat DF, Noon WA, Reeve HK, Aquadro CF. Improved hybridization conditions for DNA 'fingerprints' probed with M13. Nucleic Acids Res. 1988;16(9):4161.