Biopolym. Cell. 2004; 20(1-2):34-40.
Зміни експреси мітохондріальних генів у гліобластомі людини
1Дмитренко В. В., 1Шостак К. О., 1Бойко О. І., 2Хоменко О. В., 2Розуменко В. Д., 2Малишева Т. А., 2Шамаєв М. І., 2Зозуля Ю. П., 1Кавсан В. М.
  1. Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
    Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03680
  2. Інститут нейрохірургії ім. академіка А. П. Ромоданова АМН України
    вул. Мануїльського, 32, Київ, Україна, 04050

Abstract

Дцферещійною гібридизацією бібліотеки кДНК головного мозку ембріона людини виявлено 80 клонів, які різнилися за інтенсивністю сигналу з пробами тотальних кДНК гліобластоми та нормального головного мозку людини. Гібридизація відібраних клонів з тими ж пробами кДНК підтвердила цей результат для 38 клонів. Як показав аналіз, рівень вмісту нуклеотидних послідовностей шести клонів, до складу яких входять Аіи-повтори, зростає в гліобластомі 20 клонів містили кДНК мітохондріальних білків — субодиниць II та III оксидази цитохрому С, субодиниці 6 АТР-синтази, субодиниць І та 4 NADH-дегідрогенази, а також 12S рРНК. Для всіх мРНК, які відповідають цим мітохондріальним білкам, знайдено зменшення їхнього вмісту в гліобластомі порівняно з прилеглою до пухлини зоною нормального головного мозку.

References

[1] Sager R. Expression genetics in cancer: shifting the focus from DNA to RNA. Proc Natl Acad Sci U S A. 1997;94(3):952-5.
[2] Sambrook J., Fritch E.P., Maniatis T. Molecular cloning. A Laboratory Manual, New York: Cold Spring Harbor Lab. press 1989 p. 625.
[3] Chomczynski P, Sacchi N. Single-step method of RNA isolation by acid guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform extraction. Anal Biochem. 1987;162(1):156-9.
[4] Holmes DS, Quigley M. A rapid boiling method for the preparation of bacterial plasmids. Anal Biochem. 1981;114(1):193-7.
[5] Dmytrenko VV, Shostak KO, Haryfulin OM, Zozulya YuP, Kavsan VM. Changes of gene expression in cells of the human brain astrocytomas. Exp. oncol. 1998; 20:1-7.
[6] Zozulia IuA, Shostak EA, Garifulin OM, Rozumenko VD, Khomenko AV, Dmitrenko VV, Kavsan VM. Role gene expression changes in development of human brain gliomas. Zh Vopr Neirokhir Im N N Burdenko. 2002;(2):43-9;
[7] Shostak KO, Dmitrenko VV, Garifulin OM, Rozumenko VD, Khomenko OV, Zozulya YA, Zehetner G, Kavsan VM. Downregulation of putative tumor suppressor gene TSC-22 in human brain tumors. J Surg Oncol. 2003;82(1):57-64.
[8] Kleihues P, Louis DN, Scheithauer BW, Rorke LB, Reifenberger G, Burger PC, Cavenee WK. The WHO classification of tumors of the nervous system. J Neuropathol Exp Neurol. 2002;61(3):215-25.
[9] Yamamoto M, Maehara Y, Takahashi K, Endo H. Cloning of sequences expressed specifically in tumors of rat. Proc Natl Acad Sci U S A. 1983;80(24):7524-7.
[10] Grigoryan MS, Kramerov DA, Tulchinsky EM, Revasova ES, Lukanidin EM. Activation of putative transposition intermediate formation in tumor cells. EMBO J. 1985;4(9):2209-15.
[11] Limborska SA, Korneev SA, Maleeva NE, Slominsky PA, Jincharadze AG, Ivanov PL, Ryskov AP. Cloning of Alu-containing cDNAs from human fibroblasts and identification of small Alu+ poly(A)+ RNAs in a variety of human normal and tumor cells. FEBS Lett. 1987;212(2):208-12.
[12] White RJ, Stott D, Rigby PW. Regulation of RNA polymerase III transcription in response to Simian virus 40 transformation. EMBO J. 1990;9(11):3713-21.
[13] Koga Y, Lindstrom E, Fenyo EM, Wigzell H, Mak TW. High levels of heterodisperse RNAs accumulate in T cells infected with human immunodeficiency virus and in normal thymocytes. Proc Natl Acad Sci U S A. 1988;85(12):4521-5.
[14] Kohnoe S, Maehara Y, Endo H. A systematic survey of repetitive sequences abundantly expressed in rat tumors. Biochim Biophys Acta. 1987;909(2):107-14.
[15] Penta JS, Johnson FM, Wachsman JT, Copeland WC. Mitochondrial DNA in human malignancy. Mutat Res. 2001;488(2):119-33.
[16] Glaichenhaus N, Leopold P, Cuzin F. Increased levels of mitochondrial gene expression in rat fibroblast cells immortalized or transformed by viral and cellular oncogenes. EMBO J. 1986;5(6):1261-5.
[17] Corral M, Paris B, Baffet G, Tichonicky L, Guguen-Guillouzo C, Kruh J, Defer N. Increased level of the mitochondrial ND5 transcript in chemically induced rat hepatomas. Exp Cell Res. 1989;184(1):158-66.
[18] Yamamoto A, Horai S, Yuasa Y. Increased level of mitochondrial gene expression in polyps of familial polyposis coli patients. Biochem Biophys Res Commun. 1989;159(3):1100-6.
[19] Haugen DR, Fluge O, Reigstad LJ, Varhaug JE, Lillehaug JR. Increased expression of genes encoding mitochondrial proteins in papillary thyroid carcinomas. Thyroid. 2003;13(7):613-20.
[20] Sharp MG, Adams SM, Walker RA, Brammar WJ, Varley JM. Differential expression of the mitochondrial gene cytochrome oxidase II in benign and malignant breast tissue. J Pathol. 1992;168(2):163-8.
[21] Heerdt BG, Chen J, Stewart LR, Augenlicht LH. Polymorphisms, but lack of mutations or instability, in the promotor region of the mitochondrial genome in human colonic tumors. Cancer Res. 1994;54(14):3912-5.