Biopolym. Cell. 2026; 42(Special Issue):71.
Біомаркери та інструменти молекулярної діагностики захворювань
Кореляція між виявленням bleMBL і blaNDM в ізолятах Klebsiella pneumoniae і Pseudomonas aeruginosa
- ДУ «Вінницький обласний центр контролю та профілактики хвороб
Міністерства охорони здоров'я України»
вул. Малиновського, 11, Вінниця, Україна, 21018
Abstract
Передумови/Мета. Ген blaNDM є клінічно значущим детермінантом резистентності до карбапенему, забезпечуючи стійкість до більшості β-лактамних антибіотиків. У багатьох грамнегативних бактерій він генетично пов'язаний із bleMBL у консервативному транспозоні Tn125, де будь-яке відхилення від канонічного порядку генів є прямим свідченням рекомбінації або транспозиції. Метою цього дослідження було оцінити кореляцію між виявленням bleMBL і blaNDM у K. pneumoniae і P. aeruginosa, ізольованим за допомогою таргетного та цілісного секвенування геному. Методи. Ізоляти були зібрані під час лікування 24 пацієнтів. Геномна ДНК аналізувалася за допомогою таргетного секвенування та WGS на платформі Ion S5. Дані аналізувалися за допомогою Torrent Suite та програмного забезпечення Solu. Кількість ізолятів K. pneumoniae і P. aeruginosa, які підлягають аналізу, наведена в розділі Результати. Результати. Серед ізолятів K. pneumoniae спостерігалося повне збігання (100%) між bleMBL і blaNDM; у всіх випадках обидва гени були передані плазмідним у чотири різні типи плазмід. Серед ізолятів P. aeruginosa (n = 7) обидва гени були виключно хромосомно впорядковані: bleMBL без blaNDM виявлено в 1 ізоляті (14.3%), тоді як blaNDM без bleMBL — у 2 ізолятах (28.6%) з повною узгодженістю пар генів у решті ізолятів. Висновки. 100% збіг між bleMBL і blaNDM у K. pneumoniae підтверджує високу структурну стабільність модуля Tn125 щодо плазмід, що відповідає клональному поширенню або горизонтальному переносу всього генетичного модуля, і підтримує bleMBL як надійний додатковий маркер для виявлення blaNDM. Генна дисоціація у P. aeruginosa може відображати сильнішу геномну пластичність у цьому виді, потенційно індуковану активною рекомбінацією в хромосомних регіонах MDR та незалежними інтеграційними подіями рухомих елементів, хоча підтвердження потрібне. Варто зазначити, що blaNDM були виключно хромосомно розташовані у всіх ізолятах P. aeruginosa, що відповідає раніше описаному патерну хромосомної інтеграції цього виду. У сукупності аналіз співіснування bleMBL-blaNDM може слугувати доступним епідеміологічним індикатором інструменту для розрізнення клональної передачі від горизонтального генного переносу та оцінки еволюційної динаміки MDR патогенів без порівняльного геномного секвенування.
Keywords: blaNDM, bleMBL, секвенування всього геному, цільове секвенування, резистентність до карбапенемів, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, мобільні генетичні елементи
Повний текст: (PDF, англійською)
