Biopolym. Cell. 2026; 42(Special Issue):78.
Біомаркери та інструменти молекулярної діагностики захворювань
Біомаркери мікробіоми кишечника та персоналізована корекція пробіотиків при військовому ПТСР
- Ужгородський національний університет
Народна пл., 1, Ужгород, Україна, 88000 - ТОВ EDIENS
вул. Східна, 5, «Новий мікрорайон, село Великі Лази,
Ужгородський Район, Україна, 89440
Abstract
Передумови/Мета. Посттравматичний стресовий розлад (ПТСР) стає серйозною проблемою у військовій медицині і дедалі більше асоціюється з системною та дисрегуляцією мікробіоми кишечника. Метою цього дослідження було охарактеризувати мікробіому кишківника українських військових з ПТСР, визначити відтворювана основна мікробіома і сформувати модель стратифікації ризику мікробіоми та персоналізований вибір пробіотиків. Методи. Профілювання мікробіоти кишечника проводилося у n = 41 українських військових чоловіків з ПТСР (DSM-5-TR), що складалися з двох платформних когорт: когорта 1 (n = 18, Illumina MiSeq, 16S рРНК V3–V4) та когорта 2 (n = 23, Oxford Nanopore MinION, повна довжина 16S рРНК; HAC v4.3.0, Q ≥ 10). У цей аналіз не було включено порівняльних груп без ПТСР; результатами є описова характеристика в межах більшого поточного проєкту (n=300), який також включає бойових не-ПТСР, IDP та здорові контрольні групи, будуть опубліковані окремо. Основні таксони були ідентифіковані як присутні у ≥ 75% вибірок, з відносною чисельністю >0,1%; колаборативні мережі використовували SparCC (1 000 бутстрепів, |r| ≥ 0,3, псевдо-P < 0.05, BH-FDR < 0.05). Кандидати для пробіотичних штамів були відібрані відповідно до критеріїв, встановлених літературою (антагонізм до патобіонтів, кислотостійкість, вироблення органічної кислоти), що підтверджувалося попереднім скринінгом in vitro. Результати. В обох когортах, відтворюваний результат Основна мікробіома, домінована Bacillota (Faecalibacterium prausnitzii, F. duncaniae) та Bacteroidota (Segatella copri), було ідентифіковано, незважаючи на виражену міжіндивідуальну гетерогенність (один таксон часто перевищував 40—60% відносної чисельності на пацієнта). PCA показала чітке розділення за допомогою секвенуючих платформ (PC1), що свідчить про технічну особливість ефекту пакетів; тому порівняння альфа-різноманіття були дослідницькими (тест Вілкоксона), а бета-диверсійні центроїди відрізнялися залежно від платформи (PERMANOVA, 999 перестановок). Аналіз мережі визначив Faecalibacterium duncaniae як центральний універсант Faecalibacterium duncaniae, позитивно пов'язаний із Marseillibacter massiliensis та Waltera intestinalis, а також з Blautia fibrosolvens. На основі антагонізму, кислотостійкості та виробництва органічної кислоти були обрані кандидатські штами (Lactiplantibacillus plantarum A, L. plantarum IBM B-7413, L. bulgaricus A22, Lacticaseibacillus rhamnosus S25) для персоналізованого прототипу пробіотика, DefendX. Було сформульовано попередній Microbiome-Based Risk Score, що інтегрує ці функції; його прогностична ефективність (чутливість, специфічність, AUC) наразі перевіряється у розширеній когорті. Висновки. За відсутності відповідного компаратора ці результати характеризують відтворювальну, незалежну від платформи основну мікробіому кишечника при ПТСР, а не підтверджує специфічний дисбіоз для ПТСР. Microbiome-Based Risk Score та пробіотик DefendX залишаються лабораторним прототипом in vitro/in silico стадії; їхній діагностичний та терапевтичний потенціал для військової медицини потребує валідації у більших, контрольованих дослідженнях перед розглядом клінічного застосування. Гранти. Міністерство освіти і науки України, проєкт No 0124U004303 (2024—2026).
Keywords: ПТСР, мікробіома кишечника, біомаркери, оцінка ризику, персоналізовані пробіотики, DefendX, військова медицина
Повний текст: (PDF, англійською)
