Biopolym. Cell. 2026; 42(Special Issue):78.
Біомаркери та інструменти молекулярної діагностики захворювань
Біомаркери мікробіоми кишечника та персоналізована корекція пробіотиків при військовому ПТСР
1Паллах О. В., 1Юско Л. С., 2Бурмей С. А., 1, 2Бойко Н. В.
  1. Ужгородський національний університет
    Народна пл., 1, Ужгород, Україна, 88000
  2. ТОВ EDIENS
    вул. Східна, 5, «Новий мікрорайон, село Великі Лази,
    Ужгородський Район, Україна, 89440

Abstract

Передумови/Мета. Посттравматичний стресовий розлад (ПТСР) стає серйозною проблемою у військовій медицині і дедалі більше асоціюється з системною та дисрегуляцією мікробіоми кишечника. Метою цього дослідження було охарактеризувати мікробіому кишківника українських військових з ПТСР, визначити відтворювана основна мікробіома і сформувати модель стратифікації ризику мікробіоми та персоналізований вибір пробіотиків. Методи. Профілювання мікробіоти кишечника проводилося у n = 41 українських військових чоловіків з ПТСР (DSM-5-TR), що складалися з двох платформних когорт: когорта 1 (n = 18, Illumina MiSeq, 16S рРНК V3–V4) та когорта 2 (n = 23, Oxford Nanopore MinION, повна довжина 16S рРНК; HAC v4.3.0, Q ≥ 10). У цей аналіз не було включено порівняльних груп без ПТСР; результатами є описова характеристика в межах більшого поточного проєкту (n=300), який також включає бойових не-ПТСР, IDP та здорові контрольні групи, будуть опубліковані окремо. Основні таксони були ідентифіковані як присутні у ≥ 75% вибірок, з відносною чисельністю >0,1%; колаборативні мережі використовували SparCC (1 000 бутстрепів, |r| ≥ 0,3, псевдо-P < 0.05, BH-FDR < 0.05). Кандидати для пробіотичних штамів були відібрані відповідно до критеріїв, встановлених літературою (антагонізм до патобіонтів, кислотостійкість, вироблення органічної кислоти), що підтверджувалося попереднім скринінгом in vitro. Результати. В обох когортах, відтворюваний результат Основна мікробіома, домінована Bacillota (Faecalibacterium prausnitzii, F. duncaniae) та Bacteroidota (Segatella copri), було ідентифіковано, незважаючи на виражену міжіндивідуальну гетерогенність (один таксон часто перевищував 40—60% відносної чисельності на пацієнта). PCA показала чітке розділення за допомогою секвенуючих платформ (PC1), що свідчить про технічну особливість ефекту пакетів; тому порівняння альфа-різноманіття були дослідницькими (тест Вілкоксона), а бета-диверсійні центроїди відрізнялися залежно від платформи (PERMANOVA, 999 перестановок). Аналіз мережі визначив Faecalibacterium duncaniae як центральний універсант Faecalibacterium duncaniae, позитивно пов'язаний із Marseillibacter massiliensis та Waltera intestinalis, а також з Blautia fibrosolvens. На основі антагонізму, кислотостійкості та виробництва органічної кислоти були обрані кандидатські штами (Lactiplantibacillus plantarum A, L. plantarum IBM B-7413, L. bulgaricus A22, Lacticaseibacillus rhamnosus S25) для персоналізованого прототипу пробіотика, DefendX. Було сформульовано попередній Microbiome-Based Risk Score, що інтегрує ці функції; його прогностична ефективність (чутливість, специфічність, AUC) наразі перевіряється у розширеній когорті. Висновки. За відсутності відповідного компаратора ці результати характеризують відтворювальну, незалежну від платформи основну мікробіому кишечника при ПТСР, а не підтверджує специфічний дисбіоз для ПТСР. Microbiome-Based Risk Score та пробіотик DefendX залишаються лабораторним прототипом in vitro/in silico стадії; їхній діагностичний та терапевтичний потенціал для військової медицини потребує валідації у більших, контрольованих дослідженнях перед розглядом клінічного застосування. Гранти. Міністерство освіти і науки України, проєкт No 0124U004303 (2024—2026).
Keywords: ПТСР, мікробіома кишечника, біомаркери, оцінка ризику, персоналізовані пробіотики, DefendX, військова медицина