Передумови. Затримка росту плода (IUGR) пов'язане з порушенням функції плаценти та підвищеним перинатальним ризиком. Межа між плодом і матір'ю включає плацентні ворсинки, децидуальну оболонку, амніон та імунні клітини матері; тому мультикомпартментальна транскриптоміка може надати ширше уявлення про IUGR. Мета. Встановити цільовий робочий процес транскриптоміки для IUGR та порівняння експресії між амніонами, децидуами, ворсинками плаценти та мононуклеарними клітинами крові матері. Матеріали і методи. Зразки були зібрані з однієї контрольної вагітності та однієї важкої вагітності IUGR. Для кожного випадку збирали амніон, децидуа, трофобластно збагачені ворсинки плаценти та мононуклеарну фракцію материнської крові. У випадку IUGR виявлено ріст плода нижче 3-го перцентилю – олігогідрамніо, аномальний кровотік у маткових артеріях, обмеження росту з 24 тижнів і пологи на 35-му тижні. Таргетне секвенування використовувалося транскриптом Ion Torrent S5/AmpliSeq. Аналіз включав обробку підрахунку, нормалізацію, PCA, відстані зразків та дослідницький DESeq2 — на основі порівняння експресій з елементами Log2 з компресійною реакцією та переміщенням Log2. Додаткові зразки зберігаються. Результати. PCA продемонстрували сильне розділення між біологічними компартментами; перші два основні компоненти пояснювали 77% загальної дисперсії. Аналіз відстані зразків підтвердив специфічну кластеризацію по компартментах. Експлоративний контрольний пакет IUGR. У порівнянні були ідентифіковані гени, зокрема HLA-C, HLA-DMB, TAS2R43, PSMD5, SMN2 та MRPS21. Оскільки поточне дослідження включає по одному біологічному випадку на кожен стан, скориговані p-значення не були інтерпретовані як підтверджуючі докази. Функціональне збагачення та валідація RT-qPCR плануються після розширення когорт. Висновок. Мультикомпартментальне транскриптомічне профілювання інтерфейсу плод-матір в IUGR є можливим. На цьому пілотному етапі основним результатом є компартмент-специфічний транскриптомічний розподіл, а не остаточна дискримінація в контролі IUGR. Розширення когорти дозволить порівняти тканини реплікації, функціональний аналіз, валідацію кандидатів і інтеграцію з системними моделями патології плаценти. Фінансування. Дослідження частково підтримували ALT Ukraine LLC та CHEMLABORREACTIV LLC.