Biopolym. Cell. 2026; 42(Special Issue):97.
Біомаркери та інструменти молекулярної діагностики захворювань
Поширені та специфічні для раку оральні бактеріальні таксони у пацієнтів із твердими пухлинами проти здорових родичів
1, 2Владимирець Б. О., 1Томяк М. В., 1Демидова Г. С., 1Ніколаєва В. Д., 1Вельбовець А. О., 3Ромашко І. С., 3Савченко Н. І., 3Кропельницький В. О., 4Россоха З. І., 4Горовенко Н. Г., 1Гульковський Р. В.
  1. Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
    Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, Україна, 03143
  2. Київський національний університет імені Тараса Шевченка
    вул. Володимирська, 64, Київ, Україна, 01601
  3. Національний науковий центр хірургії та трансплантації імені О.О. Шалімова
    Вул. Академіка Шалімова, 30, Київ, Україна, 03126
  4. Національний університет охорони здоров'я України імені Шупика
    вул. Дорогожицька, 9, Київ, Україна, 04112

Abstract

Передумови. Пероральна мікробіота впливає на імунітет, запалення та канцерогенез і може бути неінвазивним біомаркером раку. Оскільки більшість досліджень використовують не пов'язані контрольні групи, ми порівнювали пацієнтів із солідними пухлинами та здорових родичів, щоб відрізнити зсуви, пов'язані з раком, на основі спільної генетики та способу життя. Методи. ДНК із 31 зразка слини (11 пацієнтів із солідними пухлинами, 20 здорових родичів) була покращена за допомогою панелі Ion AmpliSeq Pan-Bacterial Research Panel, а бібліотеки секвенувалися на системі Ion S5 Plus, а біоінформатична обробка проводилася у програмному забезпеченні Torrent Suite. Пацієнти мали гетерогенні пухлини, зокрема рак молочної залози, колоректального, шлунка, яєчників, простати, щитоподібної залози та шкіри. Результати. Обидві когорти мали спільне ядро з 115 видів бактерій (кумулятивна відносна чисельність >32,06%), домінантних у типі Bacillota (>63%). У унікальних фракціях спостерігалися явні зсуви: 33 види були виявлені лише у здорових родичів (домінантна Bacteroidota, 37,5%), тоді як 29 видів були відібрані виключно з пацієнтів з пухлинами, під керівництвом Bacillota та Actinomycetota. Streptococcus pneumoniae був провідним таксоном у обох групах, але його медіанна чисельність зменшилася з ~23,6% у родичів до 14,4% серед пацієнтів. Топ-10 пухлин включали патоген, пов'язаний з пухлинами, Fusobacterium nucleus, а також Veillonella і Actinomyces, тоді як родичі мали більш збалансований профіль (Granulicatella adiacens, G. elegans, Neisseria sp., Haemophilus haemolyticus). Біомаркери, виявлені виключно у пацієнтів — Leptotrichia wadei, Streptococcus equinus, S. gallolyticus та Parvimonas micra — мають особливий клінічний інтерес через їхню встановлену роль у пухлиногенезі, включаючи імуносупресію та прозапальний епітеліальний сигнал до порушення слизової оболонки біоплівки. Streptococcus mutans був значно частішим у пацієнтів (54,5% проти 10%; p=0,02), а S. gallolyticus відповідав тягару групи щодо колоректального раку та синдрому Лінча, що відповідає відомій асоціації з злоякісними захворюваннями шлунково-кишкового тракту. Висновки. Ці пілотні результати виявляють відтворювані відмінності у складі між оральними мікробіомами пацієнтів із солідними пухлинами та їхніми здоровими родичами. Декілька пацієнт-специфічних таксонів виступають як кандидат-маркери або модулятори наявності пухлини. Для підтвердження їхньої діагностичної цінності потрібні подальші перспективні, добре спроєктовані дослідження.
Keywords: оральна мікробіома, тверді пухлини, неінвазивні біомаркери