Biopolym. Cell. 1991; 7(1):38-39.
Комп’ютерний пошук в Alu-повторах промотороподібних послідовностях для РНК-полімерази ІІ і потенційних пептидів Alu
1Мальченко С. З.
  1. Інститут молекулярної біології і генетики АН УСРС
    Київ, СРСР

Abstract

У першому мономері Alu-повторів комп'ютерним аналізом виявлені CAAT- і TATA- блоки, які характерні промоторам еукаріотичиих генів, що транскрибуються РНК-полімеразою II. У другому мономері Alu-повторів знайдені відкриті рамки зчитування, які кодують короткі пептиди. Два мажорних класи цих пептидів складають біля 75 % усіх потенціальних пептидів Alu, їх названо відповідно EAE- та GG-потенційнимн пептидами.

References

[1] Lewin B. Genes. (2nd Edition). New York, John Wiley & Sons, 1985; 734 p.
[2] Shakhmuradov IA, Kolchanov NA, Omel'ianchuk LV. et al. Evolution of Alu repeats. Novosibirsk, 1987. 55. (Preprint. USSR Academy of Sciences, Institute of Cytology and Genetics).
[3] Korneev SA. Repetitive sequences of the human genome. Genetika. 1988;24(6):965-79.
[4] Elder JT, Pan J, Duncan CH, Weissman SM. Transcriptional analysis of interspersed repetitive polymerase III transcription units in human DNA. Nucleic Acids Res. 1981;9(5):1171-89.
[5] Limborska SA, Korneev SA, Maleeva NE, Slominsky PA, Jincharadze AG, Ivanov PL, Ryskov AP. Cloning of Alu-containing cDNAs from human fibroblasts and identification of small Alu+ poly(A)+ RNAs in a variety of human normal and tumor cells. FEBS Lett. 1987;212(2):208-12.
[6] Solov'yev VV, Kel' AE, Rogozin IV, Kolchanov NA. Introduction to the theory of genetic texts. Novosibirsk, Izd-vo Novosib. un-ta, 1987; 92 p.
[7] Berdichevskiĭ FB, Chumakov IM, Kiselev LL. Decoding of the primary structure of the son3 region in human genome: identification of a new protein with unusual structure and homology with DNA-binding proteins. Mol Biol (Mosk). 1988;22(3):794-801.
[8] Fütterer J, Gordon K, Bonneville JM, Sanfaçon H, Pisan B, Penswick J, Hohn T. The leading sequence of caulimovirus large RNA can be folded into a large stem-loop structure. Nucleic Acids Res. 1988;16(17):8377-90.
[9] Allison LA, Moyle M, Shales M, Ingles CJ. Extensive homology among the largest subunits of eukaryotic and prokaryotic RNA polymerases. Cell. 1985;42(2):599-610.