Biopolym. Cell. 1991; 7(1):40-49.
http://dx.doi.org/10.7124/bc.0002B0
Огляди
Конформаційна залежність низькочастотних коливань макромолекули ДНК
1Волков С. М.
  1. Інститут теоретичної фізики АН УРСР
    Київ, СРСР

Abstract

Вивчена залежність спектру коливань макромолекули ДНК в діапазоні 10–100 см–1 від конформації подвійної спіралі (А-, В-форма, клубок). Визначена ієрархія гілок коливань макромолекули типу ДНК У низькочастотному діапазоні. Показана можливість визначення конформаційпого стану і силових постійних макромолекули по її низькочастотних спектрах. Знайдено характер температурної залежності спектрів при фазових перетвореннях подвійної спіралі. Обговорюється роль низькочастотних коливань у процесах нуклеїново-білкового впізнавання.
Повний текст: (PDF, російською)

References

[1] Volkov SN, Kosevich AM. Conformation oscillations of double-stranded DNA. Kiev, 1986. To 25. (Preprint. Inst theor. Physics; N PER).
[2] Volkov SN, Kosevich AM. Conformation oscillations of DNA. Mol Biol (Mosk). 1987;21(3):797-806. Russian.
[3] Volkov SN, Kosevich AM, Weinreb GE. Spectrum of low-frequency vibrations of DNA macromolecules. Kiev, 1988- 19 p. (Preprint. ITP-88-177E).
[4] Volkov SN, Kosevich AM, Wainreb GE. Theoretical studies in low-frequency vibrations of DNA macromolecules. Biopolym Cell. 1989; 5(6):32-39.
[5] Urabe H, Tominaga Y. Low-lying collective modes of DNA double helix by Raman spectroscopy. Biopolymers. 1982;21(12):2477-81.
[6] Lindsay S, Powell J, Rupprecht A. Observation of Low-Lying Raman Bands in DNA by Tandem Interferometry. Phys Rev Lett. 1984;53(19):1853–5.
[7] Urabe H, Hayashi H, Tominaga Y, Nishimura Y, Kubota K, Tsuboi M. Collective vibrational modes in molecular assembly of DNA and its application to biological systems. Low frequency Raman spectroscopy. J Chem Phys. 1985;82(1):531-5.
[8] Arnott S., Hukins D. W. Optimised parameters for A-DNA and B-DNA Biochem. Biophys. Res. Communs 1972 47, N 6:1504–1509.
[9] Kosevich AM. Physical mechanics of real crystals. Kiev: Naukova Dumka, 1981. 328 p.
[10] Urabe H, Tominaga Y, Kubota K. Experimental evidence of collective vibrations in DNA molecule. J Chem Phys. 1983; 78(10):5937-5939.
[11] Weidlich T, Lindsay SM, Lee SA, Tao NJ, Lewen GD, Peticolas WL, et al. Low-frequency Raman spectra of DNA: a comparison between two oligonucleotide crystals and highly crystalline films of calf thymus DNA. J Phys Chem. 1988;92(12):3315–7.
[12] Lamba OP, Wang AH, Thomas GJ Jr. Low-frequency dynamics and Raman scattering of crystals, of B-, A-, and Z-DNA, and fibers of C-DNA. Biopolymers. 1989;28(2):667-78.
[13] Saenger W. Principles of nucleic acid structure. New York: Springer, 1984; 556 p.
[14] Eyster JM, Prohofsky EW. On the B to A conformation change of the double helix. Biopolymers. 1977;16(5):965-82.
[15] Bruce A, Cowley P. Structural Phase Transitions Taylor & Francis Ltd 1981. 326 p.
[16] Sushchinskii MM. Raman spectra of molecules and crystals. Moscow: Nauka, 1969. 576 p.
[17] Urabe H, Tominaga Y. Low Frequency Raman Spectra of DNA. J Phys Soc Jpn. 1981;50(11):3543–4.
[18] Tominaga Y, Shida M, Kubota K, Urabe H, Nishimura Y, Tsuboi M. Coupled dynamics between DNA double helix and hydrated water by low frequency Raman spectroscopy. J Chem Phys. 1985;83(11):5972.
[19] Ivanov V. I. B–A transition in DNA and transcription. Biopolym Cell. 1985; 1(1):5-13.
[20] Chou KC. Origin of low-frequency motions in biological macromolecules. A view of recent progress in the quasi-continuity model. Biophys Chem. 1986;25(2):105-16.
[21] Painter PC, Mosher LE, Rhoads C. Low-frequency modes in the Raman spectra of proteins. Biopolymers. 1982;21(7):1469-72.